ご返答有難う御座います。
出品レポートから配送パターンの読み込みが出来ましたので、ソートしてメモ欄に「マケプレプライム」等を一括追加。Ｃ条件にてメモ欄にマケプレプライムが含まれている場合、-350円（送料）値引き。これで対応できそうです。
有難う御座いました。

出品レポートからは自動で判別は難しかったように思いました。

APC-Proの各メモ欄に「マケプレプライム」等の識別文言を入力し、Ｃ条件で「メモ欄にマケプレプライムが含まれている場合、現状維持」などの条件を組む必要があるかと思います。